생화학

식품, 영양 관련 쉽게 정리한 생화학 핵심 요점 요약 정리 15. 핵산의 구조와 기능

롤라❤️ 2022. 5. 14. 08:33
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15. 핵산의 구조와 기능


들어가기
⋅핵산(Nucleic acid, NA) = 염기(base) + 오탄당인 리보오스 or 디옥시리보오스가 연결된
뉴클레오시드 + 인산기(Pi)가 연결된 뉴클레오티드들의 연속적으로 결합된 폴리뉴클레오티드인
RNA 또는 DNA를 지칭함
세포 대사과정, 호르몬이나 외부자극에 대한 세포들이 반응관련, 조효소와 중간대사물의 구조적
구성 성분
유전 정보의 저장, 전달 단백질 합성 등에 관련된 유전정보로 제공되는 DNA 및 RNA의
기본단위

1. 염기 : 퓨린과 피리미딘

⋅핵산을 이루는 기본 단위체는 뉴클레오티드
⋅뉴클레오티드 = 당, 염기, 인산으로 구성
⋅뉴클레오시드 = 오탄당 + 염기만 결합한 구조
⋅DNA나 RNA 핵산은 이러한 기본단위를 연속해서 결합시킨 생체 고분자
⋅구조적으로 피리미딘(pyrimidine)염기와 퓨린(purine)염기로 구분
⋅피리미딘 염기는 질소를 함유한 육각형 탄소 고리모양의 방향족 화합물
⋅퓨린 염기는 피리미딘 고리화합물을 닮은 육각형이미다졸 구조의 오각형 고리화합물이 서로
붙어 있음
⋅세포 내에서는 두 가지 퓨린 염기와 세 가지 피리미딘 염기가 주로 발견됨
- 퓨린 염기 : 아데닌(A), 구아닌(G)
- 피리미딘 염기 : 시토신(C), 우라신(U), 티민(T)

2. 오탄당 : 리보오스와 디옥시리보오스

⋅RNA를 구성하는 리보뉴클레오티드 : D-리보오스 오탄당을 가짐
⋅DNA를 구성하는 디옥시리보뉴클레오티드 : D-2-디옥시리보오스 오탄당을 가짐
⋅오탄당 구조 : 각각 고리형 푸라노오스 구조로 존재함
⋅액체상태에서는 알데히드와 β-푸라노오스 구조가 평형상태로 존재하나, DNA와 RNA에서는 오
직 환-구조의 푸라노오스 형태만 가짐
⋅오탄당 탄소들의 번호 : 1‘, 2’, 3‘ ·····식의 순서를 정하고, “ ’ ”는 ‘프라임’이라 읽음
⋅C1-OH의 -OH와 염기에 있는 -NH의 H가 물이되어 탈수되면서 결합하고, 5‘-탄소에 순차적
으로 3개까지 결합 가능
⋅DNA에 쓰이는 디옥시리보푸라노오스는 2‘-탄소에 붙어 있는 -OH가 환원되어 2’-H로 됨

3. 뉴클레오시드
⋅오탄당에 염기가 연결된 화합물
⋅퓨린 염기 9번 위치에 있는 -NH + 오탄당의 1‘-탄소에 붙어 있는 -OH사이에서 물 분자가 탈
수되면서 결합 → N-β-글리코시드결합의 퓨린 뉴클레오시드가 형성
⋅피리미딘 1번 위치의 -NH + 오탄당에 있는 1‘-탄소의 -OH사이에 물 분자가 탈수되면서 결합
→ 피리미딘 뉴클레오시드가 형성됨
⋅뉴클레오시드 명칭 : 퓨린 염기가 결합된 경우, 퓨린 이름의 어미 –osine을 붙임
(예) 리보오스 오탄당 + 아데닌 염기 = 아데노신
⋅피리미딘의 경우, 그 이름의 어미를 -idine을 붙임 (예) 리보오스 오탄당 + 티민 = 티미딘
⋅오탄당의 친수성 성질로 인하여 수용성, RNA에 쓰이는 리보오스 오탄당은 DNA에 쓰이는 오
탄당보다 -OH 기가 하나 더 많아 반응성이 더 높고, 화학적으로는 안정성이 떨어짐

4. 핵산의 기본 구성
⋅뉴클레오티드 = 뉴클레오시드의 5‘-CH2OH의 -H와 인산 그룹의 -OH 사이에 물 분자 하나가
탈수되면서 결합한 구조
⋅순차적으로 물 분자가 탈수되면서 인산기가 3개까지 뉴클레오시드에 결합
⋅핵산(NA)은 뉴클레오티드들이 인산다이에스테르결합으로 연결된 중합체 분자임
⋅일련의 연결된 뉴클레오티드 순서에 유전적 정보가 내장되어 있음
⋅핵산에는 디옥시리보핵산(DNA)과 리보핵산(RNA)가 있음
1) 뉴클레오티드 ⋅세 가지 구성성분을 가짐 → 질소를 함유한 염기, 리보오스 또는 디옥시리보오스 오탄당, 인산
⋅뉴클레오시드에 인산이 1~3개까지 에스테르결합으로 결합된 것, 인산은 오탄당의 5번째 탄소
-CH2OH와 에스테르 결합을 하고 있음

2) 뉴클레오티드의 인산디에스테르 결합(=포스포디에스테르)
⋅뉴클레오티드들은 인산기를 ‘연결다리’로 삼아 공유결합되어 있음
⋅오탄당의 3‘-OH 그룹의 -O-와 다음에 연결되는 뉴클레오티드의 5’-CH2OH에 결합되어 있는
인산기 사이에 인산다이에스테르(phophodiester) 결합이 일어난 것

※ 글리코시드결합 : 단당류와 단당류 사이에서 알데히드와 알코올 그룹 사이의 물분자 1개가 빠지면서 연 결되는 결합
※ 핵산 : DNA 또는 RNA 형태로서 첫 번째 뉴클레오티드의 3‘-OH와 다음 번 뉴클레오티드의 α-위치 인 산기 사이에
인산디에스테르 결합으로 연결되고, 3’-OH와 세 번째 뉴클레오티드의 α-위치 인산기와 또 인산디에스테르 결합이
계속 연결되어가는 분자


5. 핵산의 구조
뉴클레오티드의 인산기는 생리적인 pH 조건에서 양성자가 해리되어 음이온을 띔 → 친수성
⋅염기 부분 : 전하를 띠지 않는 소수성
⋅퓨린피리미딘 염기들은 세포 내 중성 pH 조건에서 소수성 → 물에 잘 녹지 않음, 서로 평
행으로 겹쳐져 위치함
수소결합은 핵산의 두 개 서로 다른 가닥 간에 상보적 염기쌍을 이루어 AT, 그리고 GC
사이에 수소결합각각 2개와 3개씩 이루어져 있음

1) 핵산의 종류
DNA는 유전정보를 저장하고 있는 이중나선 구조와 유연한 폴리뉴클레오티드 구조
RNA는 유전정보를 전달하는 전달체 → DNA로부터 전사되어 DNA와 단백질 사이의 중요한
연결자 역할
- rRNA : 리보좀 단백질과 함께 2차 구조 형태로 리보좀 형성
- mRNA : 합성할 수 있는 유전적 정보(codon)로 전사된 것
- tRNA : 20가지 아미노산을 단백질 합성하는 장소인 리보좀으로 옮겨다 줌

2) DNA 구조

- DNA 염기 구성은 다른 종간에 서로 다름 -같은 종의 서로 다른 조직에서 분리된 DNA 시
료는 같은 염기 구성을 가짐
- 어떤 주어진 종에서 나온 DNA의 염기 구성은 나이, 영양상태 또는 환경에 따라 달라지지
않음
- 종에 관계없이 모든 세포 내 DNA에는 아데닌 숫자와 티민 숫자 그리고 구아닌 숫자와 시토
신 숫자가 서로 같음
- [A] = [T], [G] = [C]
- 퓨린 염기 총 숫자와 피리미딘 염기 총 숫자는 같음. 즉, [A+G] = [T+C]
DNA 이중나선은 상보적 염기쌍 사이의 수소결합과 소수성 염기들이 서로 겹쳐지는 반데르발
스 힘 등으로 형성
DNA 두 가닥 사이의 상보성은 염기쌍 사이의 수소결합 때문이고, 이 수소결합은 DNA의 복제
와 전사에서 그대로 유전정보를 보존하고 전달하는데 중요함
염기들이 겹쳐져서 생긴 반데르발스 힘은 이중나선을 안정화시킴

3) 서로 다른 형태의 DNA 이차 구조
그 밖에 특이한 DNA 구조는 회문식(palindrome)구조, 머리핀(hair-pin)구조, 십자형(cruci)형
태가 있음
① 회문식(palindrome)구조
두 가닥의 DNA 상에서 축을 중심으로 위쪽 가닥 염기서열
GAA가 상보적인 아래쪽 다가의 같은 중심축으로부터 반대방향에서 염기가 GAA 서열로 배열
되어 있는 구조
특정한 제한효소에 의해 인식되어 인산디에스테르 결합이 끊어져서 DNA가 결국 절단됨
② 머리핀(hair-pin) 구조 & 십자형(cruci) 형태
⋅한쪽 가닥의 어느 기준점에서 보면 서로 상보적인 서열을 갖는 DNA가 있음
⋅TGCGATACTCATCGCA--같은 구조에서 내부적으로 TGCGATATCGCA부분이 서로 수소
결합하여 줄기(stem)구조를 이루고 ACTC 부분은 수소결합이 없는부분은 루프(loop) 구조를
이루어 머리핀 형태 도는 십자형 형태를 이룸

4) DNA의 실제 모습
⋅원핵세포 : 세포 내에서 특정한 단백질들과 약간의 RNA들이 DNA와 연관되면서 수많은 루프
(loop)구조를 이루 어 질서있는 핵양체(nucleoid)구조를 이룸
⋅진핵세포의 DNA는 여덟 개의 히스톤 단백질 덩어리를 휘감아 뉴클레오좀 구조를 이루고 →
연속적으로 연 결되어 염색질(chromatid)구조로 핵 안에 존재함


6. 핵산의 물리화학적 특성
⋅A와 T 또는 G와 C 염기쌍 사이의 수소결합은 화학적으로 약한 결합이므로 DNA가 복제되고
전사될 때는 쉽게 가닥간의 분리가 일어나기에 적합함
⋅수소결합의 특성이 세포에서 매우 중요하며, 그 특성 때문에 DNA 정보가 서서히 변경되면서
진화하는 역량을 보임
⋅암의 발생과 세포 노화 과정은 DNA의 비가역적인 변화가 서서히 축적되어 발생하는 것으로
알려짐
- DNA는 변화를 받아들이거나, 재빨리 교정하는 능력으로 변화를 조절하거나 복구함
- RNA는 분자의 변화에는 교정하거나 복구하지 않고, RNA 분자를 많이 만들어 그들 중에서
온전한 것만 사용함

1) DNA 및 RNA의 변성 ⋅세포로부터 분리된 DNA 용액은 실온의 pH 7.0에서 점성이 높음
⋅pH ↑ & 80oC 이상의 온도 → 점성감소
⋅이중나선 DNA 염기쌍 사이의 수소결합이 끊어져 각각의 가닥으로 분리되기 때문
DNA 변성 (denaturation)이라 함
⋅녹는점 :GC 염기쌍 >AT 염기쌍 → 수소결합 수 차이
⋅고정된 pH와 이온세기의 조건하에서 DNA 종류의 Tm값을 측정하면 그것의 염기 구성을 추정
해 볼 수 있음
⋅AT 염기쌍이 특별히 많은 부분은 그 부분이 먼저 변성됨

2) 핵산의 하이브리드화
⋅DNA나 RNA의 가닥과 가닥사이에 서로 짝을 이룰 수 있는 능력을 이용하여 서로 다른 생물의
유전체 사이에 유사한 서열
이 있는 가를 찾을 때 사용함
(예) 인체 세포와 생쥐 세포에서 분리된 두 종류의 DNA에 열을 가해 변성
→ 혼합하여 온도를 서서히 낮추 면 각각의 DNA 가닥들은 상보적인 DNA 가닥끼리 재결합
→ 사람 DNA 가닥들이 쥐의 DNA 가닥과 상보적인 부분이 있으면
→ 하이브리드 이중가닥을 만듦
⋅이러한 분석은 서로 다른 두 종간의 유전적, 진화적 관련성 여부를 분석하게 함

※ 이질 염색질 : 세포주기에서 아주 진하게 염색되는 부분의 DNA들은 뉴클레오좀이 밀집되어 뭉쳐 있는 모습으로 염색됨
※ 진정 염색질 : 간기 세포주기의 염색체 DNA들은 유전정보가 자주 발현되어야 하므로 역동적으로 염색질이 많이 풀린 상태로 염색되는 부분의 DNA가 보임

3) 뉴클레오티드 및 핵산의 변형
유전정보에 영원한 변화가 생기는 DNA 구조 변경 → 돌연변이(mutation)이라 함
이러한 돌연변이의 축적은 노화 및 발암과정 등의 밀접한 관계가 있다는 증거

(1) 탈아미노화
많은 염기들은 밖에 나와 있는 아미노(-NH2)기를 스스로 상실
(예) DNA의 시토신은 탈아미노 작용으로 우라실이 되는 경우가 있음
이러한 변화가 일어나면 DNA 복구시스템이 이를 다시 바꾸어 놓음
복구 작업이 일어나지 않으면 DNA 복제 시 변형된 우라실 + 아데닌 결합
→ 시토신 탈아미노화 과정은 모든 세포의 DNA에 GC 염기쌍
, AT 염기쌍

(2) 탈염기반응
염기와 오탄당 사이의 글리코실 결합의 가수분해반응으로서 피리미딘 염기보다 퓨린 염기에서
더 높게 발생
⋅산성 조건에서 더 빨리 일어나 pH 3.0에서 DNA를 넣어두면 퓨린 염기가 제거되어 퓨린이 없
는 것으로 나옴 → 다음 세대에서 DNA를 돌연변이 시킴
자외선에 의한 DNA 변형 : 같은 가닥 위에 서로 인접한 티민과 티민 사이에 티민-티민-이합
를 형성

(3) 화학적 반응
DNA는 반응성이 높은 화학물질에 의해 손상 받음
세포 내 대사과정에서 손상을 주는 물질은 두 종류로 나뉨 → 아질산(HNO2) 또는 질산염
질소가 함유한 여러 유기분자에서 나온 아질산은 특히 염기의 탈아미노 작용을 강력히 촉진
독성이 강한 세균의 증식을 막기 위해 이러한 화합물들을 식품방부제로 쓰고 있음
소량만 사용할 경우 식품 보존에는 효과적임

(4) 산화적 반응
DNA에 가장 돌연변이성이 강한 것은 산화적 손상
과산화수소(H 2O2), 하이드록시라디칼(OH-), 초과산화물(O2-) 같은 활성화 산소들은 유기호흡
이나 빛에 의해 증가함
카탈라아제, SOD효소, 과산화효소 등의 작용으로 반응성 산소들의 독성을 제거함
일부 라디칼들은 DNA에 산화를 일으켜 결국 DNA 가닥들을 끊어 놓기도 함

(5) 효소적 반응
세포 내에서 DNA의 어떤 부분들은 효소에 의해 변형되기도 함
메틸화효소에 의한 변형 → 아데닌과 시토신은 구아닌과 티민보다 더 자주 메틸화 됨
특히, 대장균 세포 내에 외부 생물체의 DNA가 들어오면, 자신의 DNA는 메틸화 효소에 의해
메틸화 시켜 제한효소에 보호
메틸화되지 않음 외부 DNA는 제한효소에 의해 끊어지게 함


7. 뉴클레오티드의 또 다른 기능

뉴클레오티드는 핵산의 기본단위 역할 이외에 에너지 수송체, 조효소의 구성성분, 그리고 화학
적 신호전달자 역할 등도 함

1) 에너지 수송체
리보뉴클레오티드의 5‘-말단에 붙어 있는 인산기에 1~2개의 인산이 더 결합될 수 있음
→ 이들 세 개 인산 들은 오탄당에서부터 차례로 α, β, γ 위치의 인산이라 함

2) 조효소 구성성분 ⋅여러 화학적 기능을 담당하는 조효소들은 그들 구조에 아데노신 뉴클레오티드를 가짐
물질의 예로는 조효소 A(Coenzyme A), NAD+, FAD
아데노신 부분을 제거하면 조효소 기능이 없어짐

3) 조절자 역할을 하는 뉴클레오티드
제1차 신호전달물질은 세포 표면에 있는 수용체와 상호작용하여 세포 내 제2차 신호전달물질
만들어짐
2차 신호전달물질들은 세포 안에서 신호를 전환시키면서 변화에 적응하도록 유도함
일부 뉴클레오티드가 사용, 가장 흔한 것이 cAMP(adenosine 3'. 5'-cyclic monophosphate)
이고, 아데닐산 사이클라아제에 의해
ATP로부터 합성
에피네프린, 글루카곤, ACTH 등과 같은 호르몬이 표적세포에 도달 → 세포막에 있던 고유한
수용체들은 호르몬을 수용 → 아데닐산 사이클라아제를 증가 → cAMP 농도가 세포질에서 높
아지게 함
단백질 인산화효소가 인산화 → 효소 활성화 → 호르몬에 영향을 주는 물질이 합성되도록 촉진
지방조직에서 프로스타글란딘 → 아데닐산 사이클라아제 억제 → cAMP 농도 → 에피네프린
& 글루카곤에 의해 지방저장 속도가 느려지도록 조절


<확인문제>
문제 1. 다음 질소 염기 중에서 RNA와 DNA에서 모두 발견될 수 있는 염기로 옳지 않은 것은? [2016년_8번]
① 티민 ② 시토신
정답 ① ③ 구아닌 ④ 아데닌

문제 2. 다음 중 DNA에 대한 설명으로 옳은 것은 무엇인가? [2016년_17번]
① 구아닌 숫자와 시토신 숫자는 서로 다르다.
② 아데닌 숫자와 티민 숫자는 서로 같다.
③ 서른 다른 종간에도 DNA 엽기구성은 동일하다.
정답 ② ④ 삼중나선 구조의 유연한 폴리뉴클레오티드 구조이다.

문제 3. 다음 중 DNA에 대한 설명으로 옳은 것은 무엇인가? [2018년_12번]
① 구아닌 숫자와 시토신 숫자는 서로 같다.
② 아데닌 숫자와 티민 숫자는 서로 다르다.
③ 서로 다른 종간에도 DNA 임기구성은 동일하다.
정답 ① ④ 좌선성의 이중나선 형태를 보인다.

문제 4. 다음 3'-GTACCAT-5'인 뉴클레오티드의 상보적인 염기서열은 무엇인가? [2017년_19번]
① 5'-ATGGTAC-3'
② 5'-GGTTGAC-3'
③ 5'-GCAAGAT-3'
정답 ④ ④ 5'-CATGGTA-3’
문제 5. 다음 증 3'-GTACCAT-5'인 뉴클레오티드의 상보적인 염기서열은 무엇인가? [2018년_13번]
① 5'-ATGGTAC-3'
② 5'-CATGGTA-3'
③ 5'-GCAAGAT-3'
정답 ② ④ 5'-GGTTGAC-3'
문제 6. 이중나선 DNA 분자가 30%의 시토신을 갖는다면, 티민은 몇 %인가? [2017년_24번]
① 10% ② 20%
정답 ② ③ 30% ④ 40%
문제 7. 이중나선 DNA 분자가 20%의 구아닌을 갖는다면, 아데닌은 몇 %인가? [2018년_16번]
① 10% ② 20%
정답 ③ ③ 30% ④ 40%
문제 5. 다음 중 DNA에 대한 설명으로 옳은 것은 무엇인가? [2018년_12번]
① 구아닌 숫자와 시토신 숫자는 서로 같다.
② 아데닌 숫자와 티민 숫자는 서로 다르다.
③ 서로 다른 종간에도 DNA 임기구성은 동일하다.
정답 ① ④ 좌선성의 이중나선 형태를 보인다.

문제 6. 다음 중 DNA에 대한 설명 중 옳은 것은 무엇인가?
① 실온의 pH 7.0에서 점성이 대단히 낮다.
② 뉴클레오티드 간의 결합은 C-3'와 C-5'사이에서 다이에스테르 결합으로 되어있다.
③ RNA와 구조적으로 동일하다.
정답 ② ④ 삼중나선 구조의 유연한 폴리뉴클레오티드 구조이다.

문제 7. 다음 중 뉴클레오시드에 대해 바르게 설명한 것으로 옳은 것은?
㉮ 오탄당 + 인산기 + 염기의 구조이다.
㉯ 아데노신, 구아노신, 티미딘, 시티딘 등이 포함된다.
㉰ 소수성 성질을 가지고 있다.
㉱ RNA에 쓰이는 오탄당은 DNA에 쓰이는 오탄당보다 반응성이 더 높다.
정답 ③ ① ㉮㉯㉰㉱ ② ㉮㉰ ③ ㉯㉱ ④ ㉮㉯㉰

문제 8. 유기체의 DNA를 구성하는 아데닌과 티민 염기의 구성비로 옳은 것은?
정답 ① ① 1에 가깝다. ② 1/2에 가깝다. ③ 2에 가깝다. ④ 5에 가깝다.

문제 9. 다음 중 DNA의 나선형을 유지시키는 힘으로 옳은 것은?
㉮ 인산의 친수성과 염기의 소수성 사이의 극성 차이
㉯ 양쪽 가닥의 소수성 염기들간의 수소결합 : 상보적 염기쌍
㉰ 소수성 염기들이 겹쳐져서 DNA 3차 구조를 안정화시킴 : 반데르발스힘
㉱ 분자 내에서 산소와 수소 사이의 극성 공유결합
정답 ④ ① ㉮㉯㉰㉱ ② ㉮㉰ ③ ㉯㉱ ④ ㉮㉯㉰

문제10. 다음 중 DNA의 융점(melting tmeperature, Tm)에 관한 설명으로 옳은 것은?
① DNA 사슬의 purine 염기 함량에 비례한다.
② DNA 사슬의 pyrimidine 염기 함량에 비례한다.
③ DNA 사슬의 GC 염기쌍을 많이 갖는 DNA의 녹는점이 더 높다.
정답 ③ ④ DNA 사슬의 AT 염기쌍을 많이 갖는 DNA의 녹는점이 더 높다.

문제11. DNA의 이중나선 사슬의 모델을 제안한 사람은 누구인가?
① 왓슨&크릭 ② 에드먼
정답 ① ③ 레닌저 ④ 생거

문제12. DNA의 왓슨-크릭(Watson-Crick) 모형에 관한 설명으로 옳게 설명한 것은?
① 염기 사이의 공유결합
② 역평행하는 이중가닥
③ 좌선성(letf-handed) 이중 나선구조
정답 ② ④ 삼중가닥구조

문제13. 다음 중 핵단백질의 가수분해 순서로 옳은 것은?
① 핵단백질-핵산-뉴클레오시드-뉴클레오티드-염기
② 핵산-핵단백질-뉴클레오티드-뉴클레오시드-염기
③ 핵산-핵단백질-뉴클레오티드-뉴클레오시드-염기
정답 ④ ④ 핵단백질-핵산-뉴클레오티드-뉴클레오시드-염기





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