생화학

식품, 영양 관련 쉽게 정리한 생화학 핵심 요점 요약 정리 16. 핵산의 복제와 유전자의 전사 및 발현

롤라❤️ 2022. 5. 15. 06:18
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16. 핵산의 복제와 유전자의 전사 및 발현


들어가기
⋅원핵세포들은 핵이 없이 DNA가 세포질에 노출되어 있고, 세대 기간이 짧아서 모든 일들을 거
의 동시에 수행해야 함
⋅진핵세포들은 핵에서 전사된 RNA 분자들이 세포질로 나와야 단백질이 합성될 수 있음
⋅진핵세포의 유전물질 발현 및 조절과정은 원핵세포보다 더 복잡함
1. 유전자 구조
⋅세균이나 바이러스에서 사람에 이르기까지 모든 생물체들은 각자의 유전체(genome) 분자를 가짐
※유전체 : 한 생명체의 세포가 갖고 있는 총 유전정보를 칭함. 이를 지놈이라 읽음
※염색체 : 생명체 세포가 갖는 유전물질 DNA는 1개 이상의 분자로 이루어져 있는데, 이렇게 기
다란 크기의 DNA는 히스톤 단백질 덩어리를 둘러싸고 포장되어 세포주기에 따라 그 구조가
달라지며 세포분열 시기에는 아주 밀집된 형태로 뚜렷한 형태를 갖는 특징적 개수로 나타남
1) 유전자의 구성
⋅유전자(gene)은 전사되어 하나의 폴리펩티드 또는 일차 RNA(hnRNA, pre-tRNA, pre-rRNA)
을 만들어 낼 수 있는 길이의 DNA 부분
※유전자 : 하나의 폴리펩티드 또는 RNA 분자를 만들어 내는 DNA 부위 전체를 말함
⋅원핵세포의 대부분 유전자 → mRNA 한 개에서 여러 개의 단백질을 만듦
⋅진핵세포의 대부분 유전자 → mRNA 한 개에서 단백질 한 개를 만들어 냄
⋅진핵세포의 유전자는 엑손(exon)과 인트론(intron)으로 나뉨
※엑손 : 단백질의 아미노산 서열을 지정하는 mRNA 부분을 구성
※인트론 : 1차 전사체로는 전사되지만 세포질에 나온 mRNA에는 나타나지 않는 부분
⋅헤모글로빈의 β-단백질 유전자는 인트론 하나가 유전자의 반 이상을 차지함
(예) 오브알부민 유전자 → 여러 개의 짧은 크기의 엑손들이 흩어져 있음
⋅반면에 히스톤 유전자는 인트론이 없이 엑손 하나를 가짐
⋅인트론 기능은 아직 정확히 알려져 있지 않음
2) 염색체상의 유전자
⋅인간의 46개 염색체상에는 약 31억 쌍의 염기쌍이 있음 → 적어도 29,000여개의 유전자를 갖
는다고 알려져 있음
⋅실제로 생물학적 기능을 보이는 유전자는 훨씬 많음
⋅그러므로 유전자 숫자는 중요하지 않으며, DNA의 길이가 길다가 더 많은 유전적 정보를 가진
것이라고 볼 수 없음
3) 원핵세포의 염색체 DNA의 특징
⋅전형적인 원핵생물의 유전체는 진핵세포와 기본 DNA 구조는 같지만 특징적 차이가 있음
-하나의 커다란 원형 DNA 분자로 되어 있음
-유전체 DNA 이외에도 아주 작은 크기의 플라스미드 DNA를 갖는 경우도 있음
-DNA 분자들은 초나선형 구조로 상당히 꼬여 있고, 특히 유전체 DNA는 루프 구조로 뭉쳐
있으며, 주로 세포질에 떠 있는 ‘핵양체(nucleoid)'로 되어 있음
-포장 해결방법으로는 DNA를 초나선형 감김(super coil) 상태로 존재하게 해야 함
-초나선형 감김은 ‘감긴(colied)' DNA가 또 감긴(coiling) 것을 표현한 것임

※ 복제 : 이중나선 DNA의 두 가닥이 분리되고 주형가닥으로 사용되어 새로운 뉴클레오티드들이 정확히 상보적 염기쌍으로
복사함으로써 새로운 두 쌍의 유전체를 만드는 과정
※ 전사 : 두 가닥의 DNA 사슬 중 한 쪽 가닥의 유전정보가 RNA 유전정보로 전환되는 과정
※ 단백질 합성 : 전사된 mRNA의 유전정보를 토대로 아미노산 순서가 결정되어 펩티드결합으로 폴리펩티드를 합성하는 과정
※ 역전사 : RNA 분자 염기서열이 DNA 분자 염기서열로 전환되는 과정


4) 진핵세포의 염색체 DNA 특징
진핵세포들의 DNA는 핵 속에 있음
세포분열이 끝난 세포의 DNA들은 히스톤 단백질 옥타머(8개 단백질)를 포장하듯이 감싸서
뉴클레오좀 덩어리를 이룸
핵막은 핵공(nuclear pore)을 갖고 있어서 핵 내외로 분자들을 통과시킴
히스톤, DNA 복제효소, RNA 중합효소 등이 세포질에서 핵으로 들어가고, 핵에서 전사된 여러
크기의 RNA 분자들은 세포질로 나옴

(1) 진핵세포의 염색체 DNA
대부분 여러 DNA로 나뉘어져 있고, 서로 다른 크기의 대단히 긴 분자
염색약에 염색되므로 염색체 DNA라고도 부름
원핵세포는 대부분 1개 염색체를 갖지만, 진핵세포는 암컷과 수컷에서 하나씩을 받아서 두 개
상동염색체로 존재함

(2) 세포주기에 따른 DNA의 특징
진핵세포들은 세포주기에 따라 세포가 분열하고 성장함
-체세포분열이 끝난 세포는
GI 단계로 들어감 → 핵막이 다시 생김 → 염색체 DNA는 덜 촘촘
한 진정염색질로 바뀜 → 유전자
전사활동이 활발함
-세포주기
S 단계에 오면 DNA들이 복제
-세포주기 G2 단계에 오면 복제가 끝난 DNA들이 히스톤 단백질에 포장된 염색분체
(chromatid)상태로 체세포 분열 단계로 들어감
-체세포 분열단계(
M)에서 염색체들은 분리되어 두 개의 G1 단계세포로 나뉨
진핵세포들은 세포주기에 따라 세포가 분열하고 성장함
분열된 세포는 촘촘한
이질 염색질 구조 & 덜 촘촘한 진정 염색질 & 완전히 DNA가 노출된
부분 등으로 시간에 따라 역동적으로 바뀜
이러한 DNA 상태를
염색질(chromatin)이라 부름
염색질은 핵에 분산되어 있어서 잘 보이지 않지만,
분열시에는 촘촘한 뉴클레오좀들이 염색체
로 바뀜

2. DNA 복제
1) DNA 복제 원리
(1) 반보존적 DNA 복제
‘DNA 이중나선 모델’이 발표된 이후, 복제기작에 대해 반보존적, 보존적, 무작위 분산적 가설이
각각 제시됨
메셀슨 & 스탈 → DNA 복제는 반보존적이여서 복제 전의 한 가닥이 새로이 합성된 가닥과
염기쌍을 이룬 다고 알려짐

※ 세포 주기 : 진핵세포는 한 세포분열에서 다음 세포분열까지 4단계의 세포주기를 갖는데, G1 단계는 세 포대사과정이 활성화되고 있는 단계이며,
다음 S단계는 DNA가 복제되는 단계이고, G2 세포분열 준비단 계를 지나 곧 체세포분열(M)단계로 염색체와 세포질이 나누어짐
-분열된 세포는 촘촘한 이질 염색질 구조 & 덜 촘촘한 진정 염색질 & 완전한 DNA가 노출된 부분 등으로 시간에 따라 역동적으로 바뀜
-이러한 DNA 상태를 염색질(chromatin)이라 부름
-염색질은 핵에 분산되어 있어서 잘 보이진 않지만, 분열 시에는 촘촘한 뉴클레오좀들이 염색체로 바뀜
※ 뉴클레오좀 : 염색질의 기본 반복단위로서 4가지 히스톤 단백질이 두 개씩 모여서 8개의 옥타머 (octamer)가 되어 약 146개 염기쌍의 DNA 길이가
그룰 둘러싸면서 포장된 단위를 말함
※ 염색질 : 체세포 분열 후 핵 내에 존재하는 느슨하게 풀어진 상태의 염색체 구조로서 현미경상에서 체세 포분열 때의 염색체와 다른 구조를 보여줌

(2) 복제시작점과 양방향성 복제
케언즈(Carins) → 한 곳의 복제시작점을 알아냄
DNA의 AT 염기쌍이 풍부한 지역을 선택적으로 변성시켜 복제시켰더니 양쪽으로 버블
(bubble)이 커져가는 것을 확인함
즉, 두 DNA 가닥이 동시에 복제되고, 원형의 세곤 염색체 복제는 양쪽 방향으로 진행됨
원형의 DNA 분자는 하나의 복제시작점(ori site)에서 양쪽 방향으로 복제
진핵세포 DNA와 같이 일직선의 긴 DNA들은 시작점이 여러 개 있으며 각 시작점에서 양쪽방
향으로 복제를 시작함

2) 원핵세포 DNA의 복제
세균의 DNA 복제 : 복제시작점에서 시작 → 나선형 DNA 부분이
더욱 풀리면서
복제 신장과정 → 복제 완성 → 종결
(1) 개시단계 : 복제시작점과 DNA 나선의 풀림
복제 개시단백질(DnaA) + 복제시작점과 결합 → 약간의 DNA 부분이 풀림 → 헬리케이즈
(helicase)효소가 수소 결합을 끊음 → 나선형을 조금 더 길게 풀어줌
단일가닥결합(SSB) : 단백질이 풀어진 단일가닥 DNA에 결합하여 복제되는 동안 풀린 상태를
일정기간 유지하게 함
DNA 자이레이즈(gyrase) : 회전압력을 감소시켜 나선형을 풀리게 함
DNA 복제효소 III : 새로운 뉴클레오티드를 주형 DNA 가닥의 염기들과 상보적으로 염기쌍이
이루어지도록 함
프리메이즈(primase) 효소 : 일부 DNA 가닥을 주형으로 삼아 약 10~12개 길이의 RNA 프라
이머
를 합성

(2) 신장단계
RNA 프라이머가 만들어지면 주형 DNA 가닥의 염기와 염기쌍을 이루는 새로운 DNA 뉴클레
오티드가
프라이머의 3‘-OH에 연결되면서 DNA 복제가 계속되고 새로운 가닥이 신장되어 감
DNA 복제효소 I &II :DNA 합성
DNA 복제효소 III(DNA pol III)은 DNA를 복제하는 효소로서 10개의 단위 단백질체로 구성
신장되고 있는 DNA 가닥의 3‘-말단에 새로운 뉴클레오티드를 첨가시켜 5’-말단에서 3‘-말단으
로 DNA가 신 속히 길어지게 함
이 때, 잘못 들어온 염기의 뉴클레오티드가 들어오면 DNA 복제효소 III의 복합체에서 핵산말
단가수분해효소 활성을 가진 효소가 제거함
1960년대 오카자키(Okazaki)가 DNA 한쪽 가닥이 짧게 합성된 후, 이것들이 다시 이어지는
것을 발견함
RNA 프라이머와 연결되어 있는 약 1,000개 길이의 짧은 단편을 ‘오카자키 조각’이라 부름
→ 한 쪽은 첫 번째 프라이머에서부터 연속적으로 합성되고(선도가닥, leading strand),
→ 다른 쪽은 불연속적으로 합성되는 것(지연가닥, lagging strand)

※ 복제 시작점 : 대장균 같은 우너핵세포의 DNA 복제 시작은 한 군데에서 양쪽 방향으로 복제가 시작됨
※복제분기점 : 복제가 시작하면 두 가닥 DNA가 풀려나가면서 Y자 모양의 분기점이 복제 방향으로 나아감
※주형 : 핵산의 상보적 가닥 합성에 필요한 정확한 정보를 보여 주는 DNA 또는 RNA 사슬. RNA 합성은 DNA 주형이 필요하고,
DNA 복제에는 상보적인 양쪽 DNA 사슬이 주형으로 쓰임
※프라이머 : DNA 주형에 있는 짧은 길이의 RNA로서 복제개시점에서 DNA 뉴클레오티드가 부착할 수 있 도록 3‘-OH기를 제공함.
짧은 RNA 조각이 프리마제(primase)효소에 의해 일시적으로 만들어진 것

(3) 종결단계
두 가닥의 복제분기점이 서로 반대 방향에서 돌아오면서 만나면 복제가 종결됨
앞쪽의 뉴클레오티드와 인산디에스테르결합이 끊어짐 틈(nick)을 DNA 연결효소가 연결시켜
DNA 복제를 사실상 완결시킴

(4) 복제의 정확성
정확한 복제가 가능한 이유는 교정(proofreading) & 수선(repair) 때문
-
교정 : 핵산말단가수분해효소 활성
-
수선 : 잘못 연결된 부정한 DNA는 또 다른 복제효소 분자가 잘못된 염기짝을 제거하고 교정시킴

3) 진핵세포의 DNA 복제
원핵세포의 DNA 보다 길고 복잡한 구조를 형성하고 있음
-여러 개의 복제 시작점(ori site)을 가짐
-선형의 DNA를 가지므로 끝부분의 말단소체9telomere)구조의 복제 시작에는 텔로머레이즈
(telomerase)효소가 작용함
-뉴클레오좀 구조를 가지므로 감겨 있는 DNA를 풀어주어야 함
(1) 복제시작점
여러 곳에 있으며, AT 염기쌍 > GC 염기쌍
세포주기 동안 단 한번만의 복제가 이루어지도록 조절
두 단계의 복제시작점을 가짐 -첫 번째 : 복제가 일어나도록 준비하는 단계 -두 번째 : 복제가
준비된 복제시작점에서만 복제가 시작

(2) 이중나선 DNA의 풀림
단백질들이 DNA를 풀어주고 단일가닥결합(SSB) 단백질들이 이를 유지시켜 주어 복제가 시작되도록 함

(3) 진핵세포 DNA 복제 효소
복제효소 → 복제, 재조합, DNA 수선 등에 관여
진핵세포는 5가지 서로 다른 복제효소 α, β, γ, δ, ε 등을 가짐
-복제효소 α : 여러 단위체 단백질들의 복합체, 프리메이즈. 복제 활성 있음 & 핵산말단가수분
해효소 없음
-복제효소 δ : 원핵세포의 DNA pol III과도 같은 역할을 함. 오카자키 조각에 있는 RNA 프
라이머는 RNA 분해효소(RnaseH)가 제거시킴
-복제효소 β, ε : DNA 복구과정에 관여함
-복제효소 γ : 미토콘드리아 DNA를 복제하는데 쓰임
진핵세포 DNA 복제기구와 원핵세포와의 차이점
-유전체의 크기가 엄청 큼
-원핵세포는 염색체가 하나이지만, 진핵세포는 염색체 46개 모두 복제해야 함
-원핵세포 염색체는 원형이지만, 진핵세포는 일직선의 선형임. 선형의 DNA는 매번 복제 때마
다 끝 부분이 조금씩 없어짐

※ 틈 : 뉴클레오티드와 뉴클레오티드가 연결될 때 인산다이에스테르 결합이 안 되어 서로 끊어져 있는 상태를 말함.
DNA 리가아제(ligase, 연결효소)가 이를 연결해줌


3. DNA 변이와 수선
⋅환경으로부터 방사선, 화학적인 돌연변이원, 자연발생적인 변화 등에 노출되어 손상을 입게 됨
⋅자주 일어나지는 않지만, 손상이 치명적일 수 있고, 그로 인한 변이가 세대에서 세대로 이어질 수도 있음
1) DNA 돌연변이와 돌연변이원
⋅DNA 복제과정 중 실수로 서로 맞지 않는 염기쌍 결합이 일어나면 돌연변이(mutation)을 일으킴
⋅돌연변이가 일어난 유전자는 아미노산 서열이 바뀐 단백질을 생산하여 세포의 정상적인 기능을 손상시킴
⋅여러 효소 및 단백질들이 관여하는 복구시스템을 작동시켜 원래 DNA로 복구시킴
2) 돌연변이원에 의한 DNA 손상
(1) 염기의 알킬화
⋅DNA에서 음전하를 띠는 인산과 부분적인 음전하를 띠는 염기에 주변의 전자 친화물들이 공격
하여 알킬기를 추가시켜 알킬화 시킴
⋅알킬화된 염기들 → 복제 시 실수를 일으킴 → 돌연변이가 될 확률 ↑
(2) 자외선
⋅DNA 상의 연속된 피리미딘 염기를 연결시켜 피리미딘 이합체(pyrimidine dimers)를 만듦
⋅염기쌍 결합을 깨트려서 복제가 중단 or 다음 세대에 부정확한 염기쌍이 형성
(3) 감마선 및 X-선
⋅에너지가 큰 감마선과 X-선은 DNA 주변의 물 분자를 이온화 시킴 → DNA에 손상을 가함
⋅산소 or 질소 자유라디칼을 만들어 → DNA를 공격함 → DNA 가닥이 끊어지기도 함
3) 일반적인 DNA 복구과정
⋅DNA 복구시스템은 대부분의 생물체 내에 존재함
⋅대개 변경되지 않은 주형가닥의 염기 순서를 이용하여 변경된 가닥의 염기들을 아래와 같이복구함
① 변경된 염기 인식
② 그 염기를 제거
③ 그 틈을 DNA 복제효소와 DNA 연결효소가 복구
. DNA 수선 기작에는 뉴클레오티드 두 가닥 모두 필요함
. 수선 교정 기작에는 4 종류가 있음
-부정한 DNA 염기쌍의 수선
-직접수선
-염기절제 수선
-뉴클레오 절제 수선
(1) 부정합 DNA 염기쌍의 수선
⋅부정합 염기짝의 복구능력은 복제효소가 갖고 있음
⋅이 작용은 염기쌍 간의 수소결합이 잘못되면 복제효소의 합성속도가 느려짐 → 효소의 합성작
용 활성부위에 서 핵산말단가수분해효소 활성부위로 효소 작용이 바뀌게 됨
⋅DNA pol I(부정함 DNA 수선 효소) : 잘못 들어온 염기쌍의 비틀어진 부분을 잘라내고, 본래
의 DNA 가닥을 주형으로 내세워 새로운 뉴클레오티드로 빈 공간을 채워줌

※ 말단소체 : 진핵세포 염색체 DNA의 말단 부분
※ 텔로머레이즈 : 단백질과 RNA로 구성된 효소로, 말단소체를 복세키니다. 효소의 RNA는 말단소체의 반복서열에 상보적이다

(2) 직접수선
손상된 지역을 직접 제거한 후 복구하는 경우
빛에 의해 재활성화되는 DNA 광분해효소 이용 → 피리미딘 이합체를 직접 분해하여 정상적인
피리미딘으로 북구해냄

(3) 염기절제수선(base excision repair)
손상된 염기들은 DNA 글리코실 가수분해효소로 끊음 → AP(apurinic) 핵산내부 가수분해효소
가 자름 → 디옥시리보오스 인산디에스테라아제 효소가 인산 단위로 자른 후 → 다시 DNA
pol I이 복구함

(4) 뉴클레오티드 절제 수선
피리미딘 이합체처럼 부피가 커진 DNA 손상을 제거하는 과정
가장 중요한 수선과정의 하나임
관련되는 효소 복합체가 구조적으로 비틀려있는 지역을 찾아내어, 두 가닥을 서로 분리하여 단
일가닥결합 (SSB) 단백질을 결합시켜 안정화시킴
손상된 양 가닥의 당-인산 골격 절단 제거된 부분은 DNA pol I이 메우고 DNA 연결효소가
봉합함

4. 재조합
재조합은 DNA 분자 간의 물리적 교환
교환이 유사한 DNA 분자 사이에서 일어날 때 상동적 재조합
재조합 방법은 DNA 분자들 간에 유전물질이 상호 교환되어 재배열되기 때문에 유전적 다양성
이 증가함
재조합 과정은 대개 DNA 복제 또는 복구과정과 밀접히 관련됨

1) 재조합 모델
재조합의 종류 -일반적 재조합(상동성 재조합, homologous genetic recombination)
→ 상동성 서열을 갖는 두 DNA 사이에서 유전물질이 교환되어, 유전적 다양성을 만들어 냄.
두 가닥에 모 두 이상이 생겼을 때, DNA를 복구하는 기작임
-위치특이성 재조합(site-specific recombination)
→ 재조합 효소가 특정 위치를 인식하고 끊어서 새로운 DNA 조각과 이어줌 -유전체 전이과정
(transposition)
→ 자유롭게 이동하는 전이인자(transposon)에 의해 염색체와 염색체 내부 또는 그 사이에
DNA 조각의 이 동과 끼워 넣기를 주도하는 과정

2) DNA의 제한과 변형
대략 4~8개 정도의 특정 염기서열을 가진 DNA 내부를 전달하는 제한효소(restriction
enzyme) 또는 제한적 내부가수분해효소(restriction endonuclease)가 있음
(예) EcoRI 효소 : GATTC와 같이 이중나선의 중앙측을 기준으로 G와 A사이를 절단함
일부 세균들은 이미 제한효소를 갖고 있으며, 이 때 세균은 자신의 DNA 상에 있는 특정 염기
를 메틸화하여 자신의 제한효소 공격으로부터 보호함 → DNA 변형(modification)
제한효소 : 특정 위치의 이중나선 DNA를 절단하는 EcoRI, BamHI 등이 있음
3) 유전공학 Genetic Engineering 또는 재조합 DNA 기술
(1) 제한효소에 의한 특정 DNA 자르기
제한효소들은 특정한 염기 서열을 인식하여 DNA가 끊어지게 함
보통 4~8개까지의 특정 염기서열을 인식하는 제한효소는 DNA를 뭉뚝하게(blunt) 자르거나 한
쪽 가닥이 단 일가닥이 되게(sticky-end) 자름
(2) DNA 연결효소(ligase)
서로 다른 두 DNA 단편을 단단하게 연결시키는 효소
대개 단편으로 끊어진 인산디에스테르 결합을 이어줌
(3) 플라스미드 벡터(plasmid vector)
자연적인 플라스미드를 인공적으로 재조합시켜 만든 플라스미드 백터가 유전공학 기술에서 유
전자를 형질전 환시키는데 쓰임
재조합된 플라스미드 : 스크리닝에 편리한 항생제 내성 유전자가 있고, 그 유전자 내부에 특정
제한효소 인식 DNA 서열에 넣거나, 외부 유전자를 발현시키는 데 좋은 프로모터 DNA를 연결
시키게 함
플라스키더 벡터 DNA는 크기가 비교적 작고, 삽입되는 외부 유전자도 작음
(4) cDNA 합성
인트론 부분이 빠져서 엑손 부분만이 정보를 가진 DNA를 제조하므로 이를 클로닝하여 유용
유전자를 발현 시키는데 좋음
(5) PCR(polymerase chain reaction) 기술
특정 부위의 DNA를 반복적으로 복제시키는 방법으로서 아주 소량의 유전물질을 다량 합성할
수 있음
특정 염기서열의 양쪽 프라이머 사이의 염기서열을 정확히 다량 복제하므로 질병의 진단 등에
유용함
(6) 클로닝(cloning)
플라스미드 벡터 또는 viral 벡터 등에 외부 DNA를 동일한 제한효소로 끊어서 삽입시켜 재조
합 DNA를 만들 고, 숙주세포에 물리적 힘으로 집어넣어 숙주세포를 형질 전환시킴
형질 전환된 세포만 찾아내어 배양시킨 세포(클론)을 얻는 과정

※ 클론 : 전체 또는 일부 유전자를 공통으로 보유하고 발현하는 같은 종 또는 개체세포들을 말함
※ 클로닝 : 클론세포 또는 개체를 얻는 과정을 의미하며, 유전공학 기술에서 외래 유전자를 함유한 클론생 물체를 얻는 과정이 중요함


5. 전사과정
⋅전사과정은 DNA의 정보가 RNA 정보로 전환되는 과정으로서, DNA 복제와 유사하게 세 가지
구성요소가 필 요함
-DNA 주형가닥 : RNA 가닥을 만드는데 DNA 가닥이 필요함
-RNA 합성 기질 : ATP, GTP, CTP, UTP가 필요함
-전사기구 : RNA 중합을 촉매하는 단백질로 이루어짐
전사단위(transcription unit)는 RNA로 암호화되는 부분의 DNA 조각으로서 전사에 필요한
염기서열을 말함
프로모터, RNA 암호 부위, 종결인자 등 세가지로 구성됨
-프로모터 : 전사기구가 인식하여 결합하는 DNA 서열, 주형가닥, 전사방향을 정함
-RNA 암호 부위 : RNA 분자가 만들어지는 DNA 상의 염기서열
-종결인자(terminator) : 전사가 끝나는 지역
⋅전사결과, 세포들은 mRNA, tRNA, rRNA 등을 얻음 그 밖에도 조절 또는 촉매 역할을 하는
miRNA 등 작은 크기의 RNA들이 많이 알려져 있음
⋅RNA 합성은 DNA 합성과 달리 프라이머가 필요 없이 리보뉴클레오시드삼인산(NTP)으로부터
합성
되기 시작 함
⋅신장 중에는 RNA 분자의 3‘-OH에 NTP가 하나씩 추가됨
⋅두 번째 결합하는 RNA 뉴클레오티드는 바로 앞 뉴클레오티드늬 3‘-OH에 인산디에스테르 결
합으로 연결되 면서 pyrophosphate(PPi)가 떨어져나감
⋅이렇게 합성된 RNA 가닥은 DNA 가닥 중 주형가닥상보적이며, 역평행 관계임

1) RNA 중합효소
(1) 세균의 RNA 중합효소(RNA polymerase)
⋅세균은 한 종류의 RNA 중합효소로 만든 RNA를 합성함
⋅RNA 중합효소의 핵심효소는 α-단위체 2개, β-단위체 및 β‘-단위체, ω-단위체로 구성되어
RNA 분자의 신 장을 촉매하고, σ(시그마) 단위체까지 결합된 완전효소는 프로모터를 찾아 결
합시켜 전사를 시작하게 함

(2) 진핵세포의 RNA 중합효소
⋅세 가지 서로 다른 RNA 중합효소들이 서로 다른 종류의 RNA를 합성함
-RNA 중합효소 I (RNA pol I) : pre-rRNA -RNA 중합효소 II (RNA pol II) : mRNA 전구
체, snRNA, miRNA, snoRNA 전사 -RNA 중합효소 III (RNA pol III) : tRNA, 5S rRNA,
miRNA, snRNA 전사

2) 원핵세포의 mRNA 합성과정
(개시, 신장, 종결단계)
(1) 개시단계
RNA합성을 시작하는데 필요한 4가지
① 프로모터 인식
② 전사버블 형성
③ rNTP를 이용하여 첫 번째 뉴클레오티드 결합
④ 프로모터에서 σ-단위체의 벗어남과 전사기구가 프로모터를 떠나는 단계까지를 말함
프로모터는 전사가 시작되는 곳으로서 DNA 두 가닥 중 어느 가닥이 읽혀지고 있으며, 어느
방향으로 중합효소가 움직이는 것인가를 알려줌
세균의 프로모터들은 대부분 RNA 암호화지역 가까이 있으며, 세균들의 여러 유전자에는 공통
적인 염기서열 이 있음
그 위치에 따라 지적되는 공통염기서열은 -10 위치의 5‘-TATAAT-3'으로 표시되며, 이를 보통
TATA 박스 라함
또 다른 위치의 공통염기서열로는 -35위치에 TTGACA 서열이 있음
-
RNA 완전중합효소는 NTP의 염기가 시작점 DNA에 있는 상보적 염기와 쌍을 이루게 함
-프로모터에 결합된 채 9~12개 뉴클레오티드 길이의 전사체가 만들어지면 → σ-단위체가 프로
모터 지역에서 떨어져 나감 → 핵심효소만 남아 → 계속 신장단계로 들어감

(2) 신장단계
⋅시그마(σ) 단백질이 완전중합효소에서 떨어져 나오면 → RNA 중합효소는 핵심효소(core)로 바
뀜 → 프로모터 지역을 떠나 아래쪽으로 내려가며
RNA를 신장시킴
핵심효소가 전사를 행하면서 앞쪽 방향으로 내려가면 뒤쪽에서는 일시적으로 주형가닥과 염기
짝을 형성 → 붙어 있던 RNA 전사체는 수소결합이 끊어짐 → 대신 주형 DNA 가닥은 비주형
DNA 가닥과 다시 염기쌍을 이루어 원래 DNA 형태로 돌아감
전사는 중간에 일시중지되었다가 계속 진행하기도 함

(3) 종결단계
⋅종결인자부분까지 모두 전사되면 중합효소는 RNA 합성을 끝내고, 합성된 RNA 전사체가 방출
되며 RNA 중합효소도 DNA 주형에서 떨어져 나옴으로써 전사는 종결

6. 유전암호와 단백질 합성
1) 단백질 합성 준비과정 ⋅단백질 합성은 세포질에 있는 리보좀에서 일어남
20개 아미노산은 각각의 아미노아실-tRNA 합성효소에 의해 각 해상 tRNA에 결합됨
이 효소는 tRNA의 안티코돈과 그에 해당하는 아미노산의 R-그룹들을 식별하여 특정 아미노산
을 3‘-OH에 결합시킴
피로인산(PPi)이 가수분해되어 생성되는 에너지는 아미노아실-tRNA가 계속 합성되는 방향으로

※ 핵심효소 : 세균의 중합효소는 ααββ'ω 단위체들이 결합되어 RNA 합성의 신장단계를 담당
※ 완전효소 : 핵심효소에 σ(시그마)-단위체가 결합되면 전사시 프로모터를 인식


2) 코돈과 안티코돈
(1) 코돈(codon)
한 아미노산은 실제로 3개의 염기 그룹, 즉 코돈(codon)이라는 3중 암호마다 특정 아미노산으로 읽힘
대부분의 생물체들은 ‘공통 유전암호’를 갖고 있음
코돈의 각 뉴클레오티드는 4개 염기(A, G, C, U) 중 하나를 가질 수 있음 → 64의 코돈 가능
이 중에서 종결 코돈 3개를 제외하면 61개의 전사 코돈이 20가지의 아미노산을 암호화 할 수 있음

(2) 안티코돈(Anti-codon)
tRNA 유전자가 전사 후 몇몇 기본 염기에 구조가 변형된 염기가 나타남
모든 tRNA의 구조는 매우 유사하고, 일부 내부에 상보적으로 수소결합으로 클로버 잎 모양을 함
안티코돈에는 mRNA의 코돈과 상보적으로 결합하는 3개의 염기의 안티코돈이 있음

(3) 와블현상
와블(wobble; 흔들림) 현상 : 코돈의 세 번째 염기와 tRNA 상에 있는 안티코돈 첫 번째 염기
사이의 상호결 합은 약한 상태
그래서 어떤 안티코돈들은 1개 이상의 mRNA 코돈과 짝을 이룸
퇴행성 유전 암호(degenerate code) : 두 개 이상의 코돈이 동일한 한 개의 아미노산을 암호
화할 수 있는 코돈의 성질
① 유전암호에 유연성
② mRNA상의 코돈과 tRNA상의 안티코돈 사이의 결합이 약해서 단백질 합성이 일어나고 있을
때, tRNA를 재빨리 mRNA로부터 분리시켜 단백질 합성 속도를 빨라지게 함
③ 코돈의 세 번째 염기에 해당하는 DNA 상의 염기에 돌연변이가 오더라도 변경된 단백질로 만
들어질 위험을 줄임

(4) 개시코돈과 정지코돈
mRNA 상에서 개시코돈 : AUG(중간에 나온 AUG 코돈은 일반적인 아미노산 메티오닌으로 읽힘)
⋅종결코돈(stop codon) : UAG, UGA, UAA(맞는 아미노아실-tRNA가 없어서 리보좀으로 아미
노산이 들어오지 못하여 종결됨)
개시코돈(AUG) -ORF(Open Reading Frame) -정지코돈의 배열이 이루어짐
ORF : 개시코돈으로부터 종결코돈 바로 앞까지의 중복되지 않는 코돈 서열

3) 단백질 합성
원핵세포의 단백질 합성과 변형에는 100개 이상의 단백질과 여러 종류의 RNA들이 관여함
원핵세포의 단백질 합성과정은 세 단계로 나눌수 있음
진핵세포들의 단백질 합성과정도 원핵세포와 유사함
개시단계 - 신장단계 - 종결과정으로 이루어져 있음
(1) 개시단계
mRNA와 개시인자(IF), 30S 리보좀 단위체들이 GT, N-formylmethionin-tRNAfMet 등과 함
께 30S-개시복합 체를 형성
이 때, mRNA상의 5‘-말단 쪽에 있는 SD(shine-dalgarno) 염기서열과 30S 리보좀의 16S
rRNA 사이에 일시적인 염기쌍 결합으로 복합체가 형성

(2) 신장단계
70S 개시복합체가 형성되고 나서 두 번째 코돈에 맞는 아미노산을 갖고 있는 아미노아실
-tRNA, 신장인자들이 참여함
① EF-Tu가 리보좀의 A-위치에 아미노아실-tRNA를 위치시킴. P자리에는 이미 fMet-tRNA가
있음
② 첫 아미노산인 fMet의 카르복실기(COOH)와 두 번째 아미노산의 아미노기(-NH 2) 사이에 펩
티드 결합 → 2개 아미노산을 가진 디펩티딜-tRNA가 리보좀의 A-위치에 생성
③ 아미노산 fMet을 잃은 P-위치에 남아있던 tRNA는 리보좀에서 떨어져 나가고, 70S 리보좀은
mRNA의 3‘-쪽으로 한 코돈만큼 이동
④ 신장인자 EF-G가 mRNA와 디펩티딜-tRNA를 좌측으로 한 코돈 간격만큼 이동시킴 → 디펩
피딜-tRNA가 P 자리로 이동되고 탈아실화된 첫 번째 tRNA를 밖으로 내보냄
⑤ A 자리는 비어있게 되므로 세 번째 새로운 아미노아실-tRNA가 들어와 펩티드 결합이 반복됨
GTP가 가수분해되어 에너지로 쓰임
즉, 아미노산 하나가 연결될 때마다 GTP 두 개가 하나는 아미노산 운반(아미노아실-tRNA 형
성에 쓰임), 다 른 하나는 A 위치에서 P 위치의 자리 옮김에 쓰임

(3) 종결과정
리보좀 A-위치에 종결코돈인 UAG, UGA, UAA 중 하나가 들어오면, 상보적 안티코돈을 가진
아미노아실 -tRNA가 존재하지 않아서 아미노산을 가진 tRNA가 들어오지 않게 됨
대신 그 자리에 방출인자(RF 1)가 자리하여 펩티드전이효소를 활성화시켜서 tRNA와 단백질
간에 생긴 에스테르 결합이 가수분해되어 서로 떨어지게 함


<확인문제>
문제 1. RNA 전사과정에서 아미노산을 분석 및 해석하기 위해서는 코돈(codon)이 필요하다.
mRNA상에서 복제를 시작하는 단계인 개시코돈은 다음 중 무엇인가? [2016년_9번]
정답 ③ ① UAG ② UGA ③ AUG ④ AGU

문제 2. 유전암호 코돈(codon)에 대한 설명으로 옳지 않은 것은? [2016년_32번]
① 대부분의 생물체들은 공통의 유전암호를 갖고 있다.
② 하나의 아미노산을 지정하는 3개의 염기로 된 서열이다.
③ 한 아미노산이 한 개 이상의 코돈을 가질 수 있다.
정답 ④ ④ 코돈은 3‘ → 5’ 방향으로 읽힌다.

문제 3. 64가지 가능한 코돈 중에서 그에 맞는 아미노아실-tRNA가 없어서 리보좀으로 아미노산이 들어
오지 못하는 코돈을 종결코돈이라고 한다. 다음 중 종결코돈이 아닌 것은? [2017년_26번]
정답 ④ ① UAG ② UGA ③ UAA ④ AUG

문제 4. 64가지 가능한 코돈 중에서 그에 맞는 아미노아실-tRNA가 없어서 리보좀으로 아미노산이 들어
오지 못하는 코돈을 종결코돈 이라고 한다. 다음 중 종결코돈으로만 나열된 것은? [2018년_18번]
① UAA, UGU, UAG
② UAA, UGA, UAG
③ UAA, UGA, UGG
정답 ② ④ UUC, UGA, UAG

문제 5. 유전암호 코돈(codon)에 대한 설명으로 옳은 것은? [2017년_32번]
① 코돈의 뉴클레오티드는 3개 임기를 가지므로 3x3x3=27개의 코돈이 가능하다.
② 하나의 아미노산을 지정하는 3개의 염기로 된 서열이다.
③ 한 개의 코돈은 반드시 한 개의 아미노산만 암호화할 수 있다.
정답 ② ④ 코돈은 3' → 5' 방향으로 읽힌다.

문제 6. 유전암호 코돈(codon)에 대한 설명으로 옳은 것은? [2018년_20번]
① 코돈의 뉴클레오티드는 4개 염기를 가지므로 4 x 4 x 4 = 64개의 코돈이 가능하다.
② 하나의 아미노산을 지정하는 4개의 임기로 된 서열이다.
③ 한 개의 코돈은 반드시 한 개의 아미노산만 암호화할 수 있다.
정답 ① ④ 코돈은 3' → 5' 방향으로 읽힌다.

문제 7. 다음 중 단백질 합성과정에서 tRNA와 결합하는 것으로 볼 수 있는 것은 무엇인가? [2018년_35번]
① AMP ② 펩티드
정답 ③ ③ 아미노산 ④ 안티코돈
문제 8. 다음 중 DNA 복제에 필요한 물질로 옳은 것은?
㉮ RNA 중합효소 ㉯ RNA 프라이머 ㉰ 제한효소 ㉱ DNA 복제효소 I, II, III
정답 ③ ① ㉮㉯㉰㉱ ② ㉮㉰ ③ ㉯㉱ ④ ㉮㉯㉰

문제 9. 다음 중 DNA 전사과정에 필요한 인자로 옳은 것은?
㉮ DNA 주형가닥 ㉯ 전사기구 ㉰ GTP㉱ rRNA
정답 ④ ① ㉮㉯㉰㉱ ② ㉮㉰ ③ ㉯㉱ ④ ㉮㉯㉰

문제10. 다음 중 DNA 복제에 대한 설명 중 옳지 않은 것은?
① 원핵생물 DNA는 양쪽 방향성의 복제를 한다.
② 진핵생물 DNA는 복제개시점이 오로지 하나만 존재한다.
③ 지연가닥은 오카자키조각의 형성으로 완성된다.
정답 ② ④ DNA 복제는 2가닥 모두가 복제시 주형가닥이 된다.






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